Le microbiote au cours de la vie

Les déterminants du microbiote intestinal du nourrisson humain après l'introduction des premiers aliments complémentaires dans des échantillons de nourrissons provenant de cinq centres européens


https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/micro/10.1099/mic.0.042143-0 Fallani, Matteo et al. “Determinants of the human infant intestinal microbiota after the introduction of first complementary foods in infant samples from five European centres.” Microbiology (Reading, England) vol. 157,Pt 5 (2011): 1385-1392. doi:10.1099/mic.0.042143-0




Les entérotypes dans la composition des communautés microbiennes intestinales


https://www.nature.com/articles/s41564-017-0072-8 Costea, P.I., Hildebrand, F., Arumugam, M. et al. Enterotypes in the landscape of gut microbial community composition. Nat Microbiol 3, 8–16 (2018). https://doi.org/10.1038/s41564-017-0072-8




La transmission de la mère au nourrisson de souches bifidobactériennes intestinales a un impact sur le développement précoce du microbiote du nourrisson accouché par voie vaginale.


https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/24244304/#:~:text=Conclusions%3A%20Among%20infants%20born%20vaginally,vaginal%20delivered%20infant's%20intestinal%20microbiota. Makino, Hiroshi et al. “Mother-to-infant transmission of intestinal bifidobacterial strains has an impact on the early development of vaginally delivered infant's microbiota.” PloS one vol. 8,11 e78331. 14 Nov. 2013, doi:10.1371/journal.pone.0078331




Le microbiote intestinal, maître du développement et de la physiologie de l'hôte


https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23435359/ Sommer, Felix, and Fredrik Bäckhed. “The gut microbiota--masters of host development and physiology.” Nature reviews. Microbiology vol. 11,4 (2013): 227-38. doi:10.1038/nrmicro2974





La révolution métagénomique

Métagénomique : La révolution dans le monde biomédical


https://www.imedpub.com/articles/metagenomics-the-revolution-in-the-biomedical-world.php?aid=21391
De R (2017) Metagenomics: The revolution in the biomedical world. Br J Res Vol. 4 No 5: 35. doi: 10.21767/2394-3718.100035




Analyse du microbiote : Avantages de la métagénomique shotguun par rapport au séquençage 16S


https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26718401/ Ranjan, Ravi et al. “Analysis of the microbiome: Advantages of whole genome shotgun versus 16S amplicon sequencing.” Biochemical and biophysical research communications vol. 469,4 (2016): 967-77. doi:10.1016/j.bbrc.2015.12.083





Les fonctions du microbiote intestinal

Extraire le microbiote de l'intestin humain pour trouver de nouveaux gènes de résistance au stress


https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3463497/ Culligan, Eamonn P et al. “Mining the human gut microbiome for novel stress resistance genes.” Gut microbes vol. 3,4 (2012): 394-7. doi:10.4161/gmic.20984




Une approche ciblée sur les gènes pour étudier la communauté bactérienne intestinale productrice de butyrate


https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4126176/
Vital, Marius et al. “A gene-targeted approach to investigate the intestinal butyrate-producing bacterial community.” Microbiome vol. 1,1 8. 4 Mar. 2013, doi:10.1186/2049-2618-1-8




Les métabolites spécialisés du microbiote dans la santé et la maladie


https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25440054/ Sharon, Gil et al. “Specialized metabolites from the microbiome in health and disease.” Cell metabolism vol. 20,5 (2014): 719-730. doi:10.1016/j.cmet.2014.10.016




Lier le microbiote de l'intestin humain à la capacité de production de cytokines inflammatoires


https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27814509/ Schirmer, Melanie et al. “Linking the Human Gut Microbiome to Inflammatory Cytokine Production Capacity.” Cell vol. 167,4 (2016): 1125-1136.e8. doi:10.1016/j.cell.2016.10.020




Biotransformations microbiennes dans l'intestin distal humain


https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29116650/#:~:text=Abstract,with%20our%20physiology%20and%20health.
Bik, Elisabeth M et al. “Microbial biotransformations in the human distal gut.” British journal of pharmacology vol. 175,24 (2018): 4404-4414. doi:10.1111/bph.14085




L’impact des métabolites microbiens  alimentaires de l'intestin sur l'épigénome


https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5915727/#:~:text=3.-,Summary%20and%20conclusion,expression%20of%20the%20gut%20microbiota.&text=Dietary%20agents%20may%20affect%20the,or%20through%20their%20microbial%20metabolites.
Gerhauser, Clarissa. “Impact of dietary gut microbial metabolites on the epigenome.” Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences vol. 373,1748 (2018): 20170359. doi:10.1098/rstb.2017.0359




La régulation de la fonction des cellules immunitaires par les acides gras à chaîne courte


https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4855267/ Corrêa-Oliveira, Renan et al. “Regulation of immune cell function by short-chain fatty acids.” Clinical & translational immunology vol. 5,4 e73. 22 Apr. 2016, doi:10.1038/cti.2016.17




Les bactéries comme fournisseurs de vitamines à leur hôte : une perspective de microbiote intestinal


https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22940212/ LeBlanc, Jean Guy et al. “Bacteria as vitamin suppliers to their host: a gut microbiota perspective.” Current opinion in biotechnology vol. 24,2 (2013): 160-8. doi:10.1016/j.copbio.2012.08.005




Les bactéries indigènes du microbiote intestinal régulent la biosynthèse de la sérotonine de l'hôte


https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25860609/ Yano, Jessica M et al. “Indigenous bacteria from the gut microbiota regulate host serotonin biosynthesis.” Cell vol. 161,2 (2015): 264-76. doi:10.1016/j.cell.2015.02.047




Les modifications conservées dans le microbiote intestinal grâce au by-pass gastrique réduisent le poids de l'hôte et l'adiposité


https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23536013/ Liou, Alice P et al. “Conserved shifts in the gut microbiota due to gastric bypass reduce host weight and adiposity.” Science translational medicine vol. 5,178 (2013): 178ra41. doi:10.1126/scitranslmed.3005687




La régulation de la barrière épithéliale intestinale : Fonctions immunitaires innées des lymphocytes intra-épithéliaux


https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5943048/ Hu, Madeleine D et al. “Policing the intestinal epithelial barrier: Innate immune functions of intraepithelial lymphocytes.” Current pathobiology reports vol. 6,1 (2018): 35-46.




Bactéries commensales (microflore normale), immunité des muqueuses et maladies inflammatoires et auto-immunes chroniques


https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15158604/ Tlaskalová-Hogenová, Helena et al. “Commensal bacteria (normal microflora), mucosal immunity and chronic inflammatory and autoimmune diseases.” Immunology letters vol. 93,2-3 (2004): 97-108. doi:10.1016/j.imlet.2004.02.005





Nutrition & Microbiote

Les effets de fortes doses de vitamine D3 sur le microbiote intestinal associés aux muqueuses varient selon les régions du tractus gastro-intestinal humain


https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26130323/#:~:text=Results%3A%20Vitamin%20D3%20supplementation%20changed,and%20increased%20bacterial%20richness.
Bashir, Mina et al. “Effects of high doses of vitamin D3 on mucosa-associated gut microbiome vary between regions of the human gastrointestinal tract.” European journal of nutrition vol. 55,4 (2016): 1479-89. doi:10.1007/s00394-015-0966-2




Fonctions du microbiote intestinal : métabolisme des nutriments et autres composants alimentaires


https://link.springer.com/article/10.1007/s00394-017-1445-8#citeas
Rowland, I., Gibson, G., Heinken, A. et al. Gut microbiota functions: metabolism of nutrients and other food components. Eur J Nutr 57, 1–24 (2018). https://doi.org/10.1007/s00394-017-1445-8




Analyse de la variation du microbiote intestinal au niveau de la population


https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27126039/ Falony, Gwen et al. “Population-level analysis of gut microbiome variation.” Science (New York, N.Y.) vol. 352,6285 (2016): 560-4. doi:10.1126/science.aad3503




Microbiote intestinal : L'occidentalisation et la disparition de la diversité intestinale


https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0960982215006144 Segata, Nicola. “Gut Microbiome: Westernization and the Disappearance of Intestinal Diversity.” Current biology : CB vol. 25,14 (2015): R611-3. doi:10.1016/j.cub.2015.05.040




Le rôle de l'alimentation dans le déclenchement des troubles inflammatoires humains à l'ère moderne


https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23876436/ Huang, Edmond Y et al. “The role of diet in triggering human inflammatory disorders in the modern age.” Microbes and infection vol. 15,12 (2013): 765-74. doi:10.1016/j.micinf.2013.07.004




Impact d'une intervention alimentaire sur la richesse génétique microbienne de l'intestin


https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23985875/ Cotillard, Aurélie et al. “Dietary intervention impact on gut microbial gene richness.” Nature vol. 500,7464 (2013): 585-8. doi:10.1038/nature12480





L’effet des probiotiques et prébiotiques sur le microbiote et la santé

L’effet des probiotiques, prébiotiques et synbiotiques sur la santé humaine


https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5622781/#:~:text=The%20stimulation%20of%20probiotics%20with,the%20gastrointestinal%20tract%20%5B180%5D. Markowiak, Paulina, and Katarzyna Śliżewska. “Effects of Probiotics, Prebiotics, and Synbiotics on Human Health.” Nutrients vol. 9,9 1021. 15 Sep. 2017, doi:10.3390/nu9091021




Probiotiques et prébiotiques dans la santé et les maladies intestinales : de la biologie à la clinique


https://www.nature.com/articles/s41575-019-0173-3 Sanders, M.E., Merenstein, D.J., Reid, G. et al. Probiotics and prebiotics in intestinal health and disease: from biology to the clinic. Nat Rev Gastroenterol Hepatol 16, 605–616 (2019). https://doi.org/10.1038/s41575-019-0173-3




Probiotiques : définition, champ d'application et mécanismes d'action


https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27048893/ Reid G. “Probiotics: definition, scope and mechanisms of action.” Best Practice & Research Clinical Gastroenterology, Volume 30, Issue 1, Pages 17-25, 2016 Feb. Web 2015 Dec 19. Accessed 2018 May 30. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27048893. DOI: 10.1016/j.bpg.2015.12.001





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Références Scientifiques

La science et les produits de The Serious Gut sont basés sur l’accumulation des connaissances sur des études axées autour du microbiote, de la nutrition et des bprobiotiques. Cette bibliothèque de ressources est mise à la disposition de ceux et celles que souhaitent investiguer pour aller encore plus loin.