Le microbiote au cours de la vie
Les déterminants du microbiote intestinal du nourrisson humain après l'introduction des premiers aliments complémentaires dans des échantillons de nourrissons provenant de cinq centres européens
https://www.microbiologyresearch.org/content/journal/micro/10.1099/mic.0.042143-0
Fallani, Matteo et al. “Determinants of the human infant intestinal microbiota after the introduction of first complementary foods in infant samples from five European centres.” Microbiology (Reading, England) vol. 157,Pt 5 (2011): 1385-1392. doi:10.1099/mic.0.042143-0
Les entérotypes dans la composition des communautés microbiennes intestinales
https://www.nature.com/articles/s41564-017-0072-8
Costea, P.I., Hildebrand, F., Arumugam, M. et al. Enterotypes in the landscape of gut microbial community composition. Nat Microbiol 3, 8–16 (2018). https://doi.org/10.1038/s41564-017-0072-8
Le microbiote intestinal, maître du développement et de la physiologie de l'hôte
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23435359/
Sommer, Felix, and Fredrik Bäckhed. “The gut microbiota--masters of host development and physiology.” Nature reviews. Microbiology vol. 11,4 (2013): 227-38. doi:10.1038/nrmicro2974
La révolution métagénomique
Métagénomique : La révolution dans le monde biomédical
https://www.imedpub.com/articles/metagenomics-the-revolution-in-the-biomedical-world.php?aid=21391
De R (2017) Metagenomics: The revolution in the biomedical world. Br J Res Vol. 4 No 5: 35. doi: 10.21767/2394-3718.100035
Analyse du microbiote : Avantages de la métagénomique shotguun par rapport au séquençage 16S
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/26718401/
Ranjan, Ravi et al. “Analysis of the microbiome: Advantages of whole genome shotgun versus 16S amplicon sequencing.” Biochemical and biophysical research communications vol. 469,4 (2016): 967-77. doi:10.1016/j.bbrc.2015.12.083
Les fonctions du microbiote intestinal
Extraire le microbiote de l'intestin humain pour trouver de nouveaux gènes de résistance au stress
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3463497/
Culligan, Eamonn P et al. “Mining the human gut microbiome for novel stress resistance genes.” Gut microbes vol. 3,4 (2012): 394-7. doi:10.4161/gmic.20984
Une approche ciblée sur les gènes pour étudier la communauté bactérienne intestinale productrice de butyrate
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4126176/
Vital, Marius et al. “A gene-targeted approach to investigate the intestinal butyrate-producing bacterial community.” Microbiome vol. 1,1 8. 4 Mar. 2013, doi:10.1186/2049-2618-1-8
Les métabolites spécialisés du microbiote dans la santé et la maladie
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25440054/
Sharon, Gil et al. “Specialized metabolites from the microbiome in health and disease.” Cell metabolism vol. 20,5 (2014): 719-730. doi:10.1016/j.cmet.2014.10.016
Lier le microbiote de l'intestin humain à la capacité de production de cytokines inflammatoires
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27814509/
Schirmer, Melanie et al. “Linking the Human Gut Microbiome to Inflammatory Cytokine Production Capacity.” Cell vol. 167,4 (2016): 1125-1136.e8. doi:10.1016/j.cell.2016.10.020
Biotransformations microbiennes dans l'intestin distal humain
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/29116650/#:~:text=Abstract,with%20our%20physiology%20and%20health.
Bik, Elisabeth M et al. “Microbial biotransformations in the human distal gut.” British journal of pharmacology vol. 175,24 (2018): 4404-4414. doi:10.1111/bph.14085
L’impact des métabolites microbiens alimentaires de l'intestin sur l'épigénome
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5915727/#:~:text=3.-,Summary%20and%20conclusion,expression%20of%20the%20gut%20microbiota.&text=Dietary%20agents%20may%20affect%20the,or%20through%20their%20microbial%20metabolites.
Gerhauser, Clarissa. “Impact of dietary gut microbial metabolites on the epigenome.” Philosophical transactions of the Royal Society of London. Series B, Biological sciences vol. 373,1748 (2018): 20170359. doi:10.1098/rstb.2017.0359
La régulation de la fonction des cellules immunitaires par les acides gras à chaîne courte
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4855267/
Corrêa-Oliveira, Renan et al. “Regulation of immune cell function by short-chain fatty acids.” Clinical & translational immunology vol. 5,4 e73. 22 Apr. 2016, doi:10.1038/cti.2016.17
Les bactéries comme fournisseurs de vitamines à leur hôte : une perspective de microbiote intestinal
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/22940212/
LeBlanc, Jean Guy et al. “Bacteria as vitamin suppliers to their host: a gut microbiota perspective.” Current opinion in biotechnology vol. 24,2 (2013): 160-8. doi:10.1016/j.copbio.2012.08.005
Les bactéries indigènes du microbiote intestinal régulent la biosynthèse de la sérotonine de l'hôte
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/25860609/
Yano, Jessica M et al. “Indigenous bacteria from the gut microbiota regulate host serotonin biosynthesis.” Cell vol. 161,2 (2015): 264-76. doi:10.1016/j.cell.2015.02.047
Les modifications conservées dans le microbiote intestinal grâce au by-pass gastrique réduisent le poids de l'hôte et l'adiposité
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23536013/
Liou, Alice P et al. “Conserved shifts in the gut microbiota due to gastric bypass reduce host weight and adiposity.” Science translational medicine vol. 5,178 (2013): 178ra41. doi:10.1126/scitranslmed.3005687
La régulation de la barrière épithéliale intestinale : Fonctions immunitaires innées des lymphocytes intra-épithéliaux
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5943048/
Hu, Madeleine D et al. “Policing the intestinal epithelial barrier: Innate immune functions of intraepithelial lymphocytes.” Current pathobiology reports vol. 6,1 (2018): 35-46.
Bactéries commensales (microflore normale), immunité des muqueuses et maladies inflammatoires et auto-immunes chroniques
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/15158604/
Tlaskalová-Hogenová, Helena et al. “Commensal bacteria (normal microflora), mucosal immunity and chronic inflammatory and autoimmune diseases.” Immunology letters vol. 93,2-3 (2004): 97-108. doi:10.1016/j.imlet.2004.02.005
Nutrition & Microbiote
Fonctions du microbiote intestinal : métabolisme des nutriments et autres composants alimentaires
https://link.springer.com/article/10.1007/s00394-017-1445-8#citeas
Rowland, I., Gibson, G., Heinken, A. et al. Gut microbiota functions: metabolism of nutrients and other food components. Eur J Nutr 57, 1–24 (2018). https://doi.org/10.1007/s00394-017-1445-8
Analyse de la variation du microbiote intestinal au niveau de la population
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27126039/
Falony, Gwen et al. “Population-level analysis of gut microbiome variation.” Science (New York, N.Y.) vol. 352,6285 (2016): 560-4. doi:10.1126/science.aad3503
Le rôle de l'alimentation dans le déclenchement des troubles inflammatoires humains à l'ère moderne
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23876436/
Huang, Edmond Y et al. “The role of diet in triggering human inflammatory disorders in the modern age.” Microbes and infection vol. 15,12 (2013): 765-74. doi:10.1016/j.micinf.2013.07.004
Impact d'une intervention alimentaire sur la richesse génétique microbienne de l'intestin
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/23985875/
Cotillard, Aurélie et al. “Dietary intervention impact on gut microbial gene richness.” Nature
vol. 500,7464 (2013): 585-8. doi:10.1038/nature12480
L’effet des probiotiques et prébiotiques sur le microbiote et la santé
L’effet des probiotiques, prébiotiques et synbiotiques sur la santé humaine
https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC5622781/#:~:text=The%20stimulation%20of%20probiotics%20with,the%20gastrointestinal%20tract%20%5B180%5D.
Markowiak, Paulina, and Katarzyna Śliżewska. “Effects of Probiotics, Prebiotics, and Synbiotics on Human Health.” Nutrients vol. 9,9 1021. 15 Sep. 2017, doi:10.3390/nu9091021
Probiotiques et prébiotiques dans la santé et les maladies intestinales : de la biologie à la clinique
https://www.nature.com/articles/s41575-019-0173-3
Sanders, M.E., Merenstein, D.J., Reid, G. et al. Probiotics and prebiotics in intestinal health and disease: from biology to the clinic. Nat Rev Gastroenterol Hepatol 16, 605–616 (2019). https://doi.org/10.1038/s41575-019-0173-3
Probiotiques : définition, champ d'application et mécanismes d'action
https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/27048893/
Reid G. “Probiotics: definition, scope and mechanisms of action.” Best Practice & Research Clinical Gastroenterology, Volume 30, Issue 1, Pages 17-25, 2016 Feb. Web 2015 Dec 19. Accessed 2018 May 30. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27048893. DOI: 10.1016/j.bpg.2015.12.001